根据中央建设创新型国家的总体战略目标和国家中长期科技发展规划纲要，结合中国科学院科技布局调整的要求，围绕深圳市实施创新型城市战略，2006年２月，中国科学院、深圳市人民政府友好协商，在深圳市共同建立中国科学院深圳先进技术研究院（以下简称先进技术院）。先进技术院由集成技术研究所、生物医学与健康工程研究所、先进计算与数字工程研究所、开放技术平台、工程中心、行政管理部门等部分组成，同时设立学术委员会、工业委员会。

    中国科学院香港中文大学深圳先进集成技术研究所（以下简称“集成所”）由中国科学院、深圳市人民政府和香港中文大学协商共建，致力于现代装备制造业及服务业的基础性、前瞻性、战略性的研究。

    中国科学院深圳先进技术研究院生物医学与健康工程研究所（以下简称“医工所”）为先进技术院的主要研究单元之一，致力于低成本、集成化、网络化、智能化的创新医疗设备的研究。

    开放技术平台由一系列基于仪器设备支撑的实验室组成，为先进技术院科技活动提供测试、调试、加工等技术支撑与服务，并向企业和其它科研单位开放。

    工程中心开展技术转移、成果转化与企业孵化等相关工作。依托院一流研发团队，寻求一流企业合作，以工业价值链有效嵌入为手段，追求最大的成果转化效率和效益；与一流品牌企业合作，以SPIN IN和SPIN OUT方式实现成果与产业的无缝接轨；以市场和工业需求引导院科研方向，切实建立以项目管理为中心的工业化管理体系，建设工业平台，保证合作伙伴的满意程度和产业接轨的成功。
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